胃蛋白酶原Ⅰ是胃液中胃蛋白酶的无活性前体，分为胃蛋白酶原Ⅰ和胃蛋白酶原Ⅱ两种亚群。胃蛋白酶原Ⅰ来源于胃底腺的主细胞和颈粘液细胞。胃蛋白酶原Ⅱ则来源于全胃腺（胃贲门腺、胃底腺、胃窦幽门腺）和远端十二指肠Brunner氏腺，前列腺和胰腺也产生少量胃蛋白酶原Ⅱ，胃粘膜合成的胃蛋白酶原Ⅱ约为总量的25%。合成后的胃蛋白酶原大部分进入胃腔，在酸性胃液作用下活化成胃蛋白酶，只有少量（约1%）胃蛋白酶原透过胃粘膜毛细血管进入血循环。血清胃蛋白酶原水平反映了不同部位胃粘膜的形态和功能：PGI是检测胃泌酸腺细胞功能的指针，胃酸分泌增多PGI升高，分泌减少或胃粘膜腺体萎缩PGI降低；PGII与胃底粘膜病变的相关性较大（相对于胃窦粘膜），其升高与胃底腺管萎缩、胃上皮化生或假幽门腺化生、异型增值有关；PGI/II比值进行性降低与胃粘膜萎缩进展相关。因此，联合测定PGI和PGII比值可起到胃底腺粘膜“血清学活检”的作用。